Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms