Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST1P01037 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST1P01037 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms