Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX6O95503 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX6O95503 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX6O95503 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms