Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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