Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SCN2BO60939 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SCN2BO60939 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SCN2BO60939 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SCN2BO60939 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SCN2BO60939 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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