Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CUBNO60494 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CUBNO60494 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms