Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPLO60437 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPLO60437 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPLO60437 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPLO60437 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPLO60437 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPLO60437 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPLO60437 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms