Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGTAO43765 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGTAO43765 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms