Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms