Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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