Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E9PBE3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.2 ms