Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf170A2RU37 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms