Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX11Q9Y5W9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms