Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SRPRBQ9Y5M8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms