Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM9Q9Y5J7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TIMM9Q9Y5J7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM9Q9Y5J7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms