Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN3Q9Y4C0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NRXN3Q9Y4C0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NRXN3Q9Y4C0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NRXN3Q9Y4C0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms