Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
KIF3AQ9Y496 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF3AQ9Y496 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms