Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NR2E1Q9Y466 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms