Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms