Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Q9Y3F1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms