Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPRKBQ9Y3C4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms