Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y371

SH3GLB1, Endophilin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB1Q9Y371 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB1Q9Y371 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB1Q9Y371 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GLB1Q9Y371 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GLB1Q9Y371 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GLB1Q9Y371 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GLB1Q9Y371 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GLB1Q9Y371 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GLB1Q9Y371 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GLB1Q9Y371 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms