Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M1Q9Y2T2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3M1Q9Y2T2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M1Q9Y2T2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms