Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POMPQ9Y244 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms