Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
TNNQ9UQP3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNQ9UQP3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms