Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHOC2Q9UQ13 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHOC2Q9UQ13 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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