Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A2Q9UPR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms