Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCAF8Q9UPN6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAF8Q9UPN6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms