Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCC3Q9ULS5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms