Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH7Q9ULB5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms