Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SARDHQ9UL12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms