Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GPATCH8Q9UKJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GPATCH8Q9UKJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
GPATCH8Q9UKJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms