Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC13A4Q9UKG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A4Q9UKG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms