Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GMEB2Q9UKD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMEB2Q9UKD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms