Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
GGA1Q9UJY5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GGA1Q9UJY5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms