Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3LQ9UJW3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3LQ9UJW3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms