Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSKSQ9UJT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSKSQ9UJT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms