Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC5Q9UII4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms