Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP2Q9P2J9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms