Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms