Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN3Q9P1Z3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms