Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N5

TMEM216, Transmembrane protein 216, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM216Q9P0N5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM216Q9P0N5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM216Q9P0N5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM216Q9P0N5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms