Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP1Q9NZ09 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms