Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNK4Q9NYG8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNK4Q9NYG8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms