Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HOXC10Q9NYD6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC10Q9NYD6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms