Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.19□□□□□ -2.383e-26■■■■■ 31.2
AATFQ9NY61 CEP72-202ENST00000499639 461 ntTSL 312.26□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 324.7■■□□□ 1.543e-7■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-205ENST00000565110 575 ntTSL 523.59■■□□□ 1.375e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.365e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-208ENST00000566401 522 ntTSL 323.57■■□□□ 1.365e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-206ENST00000565479 865 ntTSL 523.2■■□□□ 1.35e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-210ENST00000568674 371 ntTSL 222.77■■□□□ 1.245e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.215e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.25e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.125e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.995e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.795e-8■■■■■ 31.1
AATFQ9NY61 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 31
AATFQ9NY61 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 31
AATFQ9NY61 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 31
AATFQ9NY61 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-24■■■■■ 30.9
AATFQ9NY61 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.312e-24■■■■■ 30.9
AATFQ9NY61 NPRL3-205ENST00000457916 936 ntTSL 521.52■■□□□ 1.047e-11■■■■■ 30.8
AATFQ9NY61 NPRL3-203ENST00000422814 512 ntTSL 421.52■■□□□ 1.047e-11■■■■■ 30.8
AATFQ9NY61 NPRL3-209ENST00000483663 932 ntTSL 315.68■□□□□ 0.17e-11■■■■■ 30.8
AATFQ9NY61 NPRL3-207ENST00000468260 922 ntTSL 513.33□□□□□ -0.287e-11■■■■■ 30.8
AATFQ9NY61 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 211.33□□□□□ -0.61e-39■■■■■ 30.8
AATFQ9NY61 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.997e-27■■■■■ 30.8
AATFQ9NY61 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 28.78□□□□□ -17e-27■■■■■ 30.8
AATFQ9NY61 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.097e-27■■■■■ 30.8
AATFQ9NY61 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.431e-48■■■■■ 30.7
AATFQ9NY61 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.4■□□□□ 0.861e-48■■■■■ 30.7
AATFQ9NY61 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.521e-48■■■■■ 30.7
AATFQ9NY61 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 211.73□□□□□ -0.532e-56■■■■■ 30.6
AATFQ9NY61 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 211.67□□□□□ -0.542e-56■■■■■ 30.6
AATFQ9NY61 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.892e-56■■■■■ 30.6
AATFQ9NY61 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 57.6□□□□□ -1.192e-56■■■■■ 30.6
AATFQ9NY61 TRIM28-205ENST00000595028 486 ntTSL 218.42■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 30.4
AATFQ9NY61 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 30.4
AATFQ9NY61 TOB1-203ENST00000509385 889 ntTSL 218.63■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 30.4
AATFQ9NY61 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 30.4
AATFQ9NY61 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 30.4
AATFQ9NY61 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 30.4
AATFQ9NY61 TOB1-201ENST00000268957 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 30.4
AATFQ9NY61 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 30.3
AATFQ9NY61 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 30.3
AATFQ9NY61 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 30.3
AATFQ9NY61 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 30.3
AATFQ9NY61 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 30.3
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AATFQ9NY61 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 512.7□□□□□ -0.382e-32■■■■■ 30.2
AATFQ9NY61 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-32■■■■■ 30.2
AATFQ9NY61 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.072e-32■■■■■ 30.2
AATFQ9NY61 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-32■■■■■ 30.2
AATFQ9NY61 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 524.24■■□□□ 1.474e-32■■■■■ 30.1
AATFQ9NY61 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 214.7□□□□□ -0.064e-32■■■■■ 30.1
AATFQ9NY61 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 226.3■■□□□ 1.81e-10■■■■■ 29.6
AATFQ9NY61 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.121e-10■■■■■ 29.6
AATFQ9NY61 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 29.6
AATFQ9NY61 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-10■■■■■ 29.6
AATFQ9NY61 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-10■■■■■ 29.6
AATFQ9NY61 FUS-205ENST00000487045 952 ntTSL 214.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 29.6
AATFQ9NY61 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 29.6
AATFQ9NY61 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.631e-10■■■■■ 29.6
AATFQ9NY61 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.561e-323■■■■■ 29.6
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AATFQ9NY61 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 29.5
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AATFQ9NY61 ATP2A3-215ENST00000576957 1159 ntTSL 216.15■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 27.41□□□□□ -1.221e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 37.32□□□□□ -1.241e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 55.79□□□□□ -1.481e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25□□□□□ -1.611e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 34.59□□□□□ -1.671e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 54.12□□□□□ -1.751e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 33.91□□□□□ -1.781e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.011e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 RABGGTB-214ENST00000497648 1319 ntTSL 29.54□□□□□ -0.882e-56■■■■■ 29.5
AATFQ9NY61 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 215.86■□□□□ 0.133e-11■■■■■ 29.4
AATFQ9NY61 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-11■■■■■ 29.4
AATFQ9NY61 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 29.3
AATFQ9NY61 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 29.3
AATFQ9NY61 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 29.3
AATFQ9NY61 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 29.3
AATFQ9NY61 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 29.3
AATFQ9NY61 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 526.77■■□□□ 1.884e-6■■■■■ 29
AATFQ9NY61 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.414e-6■■■■■ 29
AATFQ9NY61 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.044e-6■■■■■ 29
AATFQ9NY61 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 320.92■□□□□ 0.942e-83■■■■■ 29
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.814e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.434e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.354e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 223.4■■□□□ 1.344e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 321.92■■□□□ 1.14e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 321■□□□□ 0.954e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 420.45■□□□□ 0.864e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.354e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.234e-15■■■■■ 28.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.224e-15■■■■■ 28.8
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