Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDKN2AIPQ9NXV6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms