Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms