Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SLC52A1Q9NWF4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SLC52A1Q9NWF4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SLC52A1Q9NWF4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLC52A1Q9NWF4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLC52A1Q9NWF4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLC52A1Q9NWF4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SLC52A1Q9NWF4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLC52A1Q9NWF4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLC52A1Q9NWF4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC52A1Q9NWF4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SLC52A1Q9NWF4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms