Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP5S1Q9NUS5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP5S1Q9NUS5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms